35 армия в составе войск Дальневосточного фронта обороняла границу СССР в Приморье. 1 мая 1945 года вошла в Приморскую группу войск, 5 августа подчинена 1-му Дальневосточному фронту.
Приняла участие в Харбино-Гиринской операции, в которой перед армией была поставлена задача разгрома частей японской Квантунской армии на левом берегу р. Сунгача и овладения Хутоуским укрепленным районом. С началом операции соединеия и части армии при содействии Краснознаменной Амурской военной флотилии форсировали реку Уссури заняли город Хулинь. Передовые отряды 12 августа захватили город Мишань, 13 августа — город Дунань, 16 августа — город Боли, чем отрезали путь отступления японским войскам, отступавшим под ударами войск 2-го Дальневосточного фронта на юг. В последние дни войны армия участвовала в разоружении капитулировавших японских войск.
Информации о наличии в составе войск 35 армии штрафных рот не имеется.