Давайте уточним. Гродно, Брест, Перемышль. Это все пограничные города, и тюрьмы в них бомбардировались 22 июня. Причем в Бресте после того, как охранники тюрьмы начали оказывать ожесточенное сопротивление. В самые первые дни войны с воздуха бомбили также тюрьмы в Луцке и в Острове Ровенской обл. Позже имел место только один эпизод - 26 июля, ночью, московская Таганская тюрьма. Ни одного больше случая бомбардировок тюрем с воздуха в 1941 г. не зафиксировано.
Также по некоторым сведениям, с воздуха были сброшены зажигательные бомбы якобы на Минскую тюрьму тоже в самые первые дни. Поднялась суматоха, которая позволила боевикам белорусского штурмового взвода освободить арестованных националистов. По другим сведениям, ни бомбардировки, ни смелого нападения не было, это просто националистическая легенда. Конвойщики увели из тюрьмы столько людей, сколько могли уводить (лимит заполняемости Минской тюрьмы 3200 (практически 3,5 тыс.) чел., конвоиров было 2 неполные роты).
Итого несомненны всего 4 случая в самом начале войны и только один позже - в Москве. Походит на те самые исключения, которые подтверждают общее правило.
Что же касается бомбы, сброшенной на дом на окраине Смоленска, то логичнее всего объяснять его "разгрузкой" бомбардировщика. При вылете на бомбежку, летчики получали задание бомбить конкретные объекты. Если какие-то из них были уже поражены, сбрасывать бомбы на них не имело смысла. Но возвращаться с бомбами на борту было нельзя. Поэтому их сбрасывали на что-либо первое попавшееся подходящее. В данном случае подвернулся жилой дом.